Οι φοιτητές του Πανεπιστημίου Κρήτης (προπτυχιακοί, μεταπτυχιακοί και υποψήφιοι διδάκτορες) δικαιούνται πλήρη ιατροφαρμακευτική και φαρμακευτική περίθαλψη στα δημόσια νοσοκομεία Ηρακλείου και Ρεθύμνου καθώς και στα Κέντρα Υγείας των δύο νομών, εάν δεν είναι ασφαλισμένοι σε κανένα ασφαλιστικό φορέα και εφόσον είναι κάτοχοι του Βιβλιαρίου Υγειονομικής Περίθαλψης Φοιτητή του Πανεπιστημίου Κρήτης. 

Στην Πανεπιστημιούπολη του Γάλλου, στο ισόγειο του Εστιατορίου λειτουργεί Ιατρείο Γενικής Ιατρικής, με στόχο την αντιμετώπιση των προβλημάτων υγείας του φοιτητή, την πρόληψη και προαγωγή της υγείας και την ψυχοκοινωνική υποστήριξη του φοιτητή. Το Ιατρείο λειτουργεί με εθελοντές ιατρούς του ΕΣΥ, μόνο συγκεκριμένες ημέρες και ώρες την εβδομάδα, και μόνο κατά την περίοδο διεξαγωγής μαθημάτων. Το τηλέφωνο του Ιατρείου είναι 28310-77980 και το Fax 28310-77983.