Το Συμβουλευτικό Κέντρο Φοιτητών (ΣΦΚ) του Πανεπιστημίου Κρήτης λειτουργεί από το Σεπτέμβριο του 2003 με σκοπό την ψυχολογική υποστήριξη των προπτυχιακών και μεταπτυχιακών φοιτητών του Ιδρύματος, τη στήριξη των φοιτητών με ειδικές εκπαιδευτικές ανάγκες, την ευαισθητοποίηση και ενημέρωση της πανεπιστημιακής κοινότητας σε θέματα που αφορούν στον τομέα της ψυχικής υγείας και τη διαμόρφωση μιας γενικότερης πολιτικής ψυχικής υγείας. Από το 2008 το Συμβουλευτικό Κέντρο Φοιτητών είναι ιδρυματικό μέλος (institutional member) της FEDORA, της Ένωσης ειδικών που ασχολούνται με την καθοδήγηση φοιτητών στην Ευρώπη.