Το Πανεπιστήμιο Κρήτης διαθέτει τις απαραίτητες δομές και υπηρεσίες για την εξυπηρέτηση των μεταπτυχιακών φοιτητών:

• Η Βιβλιοθήκη του ΠΚ είναι από τις πλέον καλά οργανωμένες στον Ελλαδικό χώρο με δύο κτιριακές εγκαταστάσεις σε Ρέθυμνο και Ηράκλειο που εξυπηρετούν με επάρκεια φοιτητές και διδακτικό – ερευνητικό προσωπικό τόσο στις ανθρωπιστικές όσο και στις θετικές επιστήμες. Ο εξοπλισμός της βιβλιοθήκης περιλαμβάνει προσωπικούς υπολογιστές για την πρόσβαση στις ηλεκτρονικές πηγές πληροφόρησης, εκτυπωτές, σαρωτές και φωτοτυπικά μηχανήματα που είναι διαθέσιμος τουλάχιστον 12 ώρες σε καθημερινή βάση.
• Το Φοιτητικό Κέντρο στο Ηράκλειο στεγάζει τις περισσότερες πολιτιστικές ομάδες και διαθέτει έναν θεατρικό χώρο για παραστάσεις και εκδηλώσεις, ραδιοφωνικό σταθμό, στούντιο ηχοληψίας, σκοτεινό θάλαμο φωτογραφίας, φοιτητικό στέκι και εστιατόριο
• Το Συμβουλευτικό Κέντρο προσφέρει σε προπτυχιακούς και μεταπτυχιακούς φοιτητές ψυχολογική υποστήριξη σε περιστασιακές δυσκολίες που σχετίζονται με αναπτυξιακά και προσωπικά προβλήματα και/ή προβλήματα προσαρμογής και στήριξη των φοιτητών με ειδικές εκπαιδευτικές ανάγκες, αναπηρία και μαθησιακές δυσκολίες
• Συνήγορος του Φοιτητή διαμεσολαβεί μεταξύ φοιτητών και καθηγητών ή διοικητικών υπηρεσιών του Ιδρύματος και γενικά φροντίζει για την τήρηση της νομιμότητας σε θέματα φοιτητικά στο πλαίσιο πάντοτε της ακαδημαϊκής ελευθερίας και της εύρυθμης λειτουργίας του Ιδρύματος.
• Η Δομή Απασχόλησης και Σταδιοδρομίας (ΔΑΣΤΑ) στηρίζει τους φοιτητές και τους αποφοίτους για την εξεύρεση εργασίας, φροντίζει την σωστή πληροφόρηση τους και την ανάπτυξη συνεργασιών με εξωτερικούς φορείς.
• Τα Πανεπιστημιακά Γυμναστήρια στο Ρέθυμνο και στο Ηράκλειο, λειτουργούν καθημερινά και διαθέτουν πλήρες αθλητικό κέντρο με κλειστό γυμναστήριο πλήρως εξοπλισμένο με όργανα καρδιοαναπνευστικής και μυϊκής ενδυνάμωσης, κλειστή πισίνα 25μέτρων (στο Ηράκλειο), κλειστό γήπεδο μπάσκετ και πολλές διαφορετικές αθλητικές ομάδες στις οποίες μπορούν να συμμετέχουν οι φοιτητές.
• Οι Ηλεκτρονικές Υπηρεσίες στις οποίες έχουν πρόσβαση οι φοιτητές μέσω των ιδρυματικών λογαριασμών τους περιλαμβάνουν μεταξύ άλλων ηλεκτρονικό ταχυδρομείο (email), πρόσβαση στο StudentWeb και στο σύστημα ηλεκτρονικής μάθησης του Πανεπιστημίου Κρήτης e-learn, πρόσβαση στο ασύρματο δίκτυο, υπηρεσία απομακρυσμένης πρόσβασης (VPN), πρόσβαση σε υπηρεσίες της Βιβλιοθήκης (εκτυπώσεις / φωτοτυπίες, ιδρυματικό αποθετήριο) κ.α.
•  Ακαδημαϊκή Ταυτότητα (πάσο): Οι μεταπτυχιακοί φοιτητές που δεν είναι ήδη κάτοχοι μεταπτυχιακού τίτλου, για όσα έτη διαρκεί η φοίτησή τους σύμφωνα με το ενδεικτικό πρόγραμμα σπουδών, μπορούν να υποβάλλουν ηλεκτρονική αίτηση για την έκδοση ακαδημαϊκής ταυτότητας στο δικτυακό τόπο http://academicid.minedu.gov.gr. Όλοι/ες οι φοιτητές/τριες που έχουν σε ισχύ το δελτίο εισιτηρίου τους, όπως αυτό προσδιορίζεται στην ακαδημαϊκή τους ταυτότητα, δικαιούνται καθ’ όλη τη διάρκεια του ακαδημαϊκού έτους μειωμένη τιμή εισιτηρίου και κάρτας απεριορίστων διαδρομών των αστικών και υπεραστικών, οδικών και σιδηροδρομικών συγκοινωνιών εντός της Επικράτειας, στα μέσα μαζικής μεταφοράς.
• Υπηρεσίες Φοιτητικής Μέριμνας, όπως σίτιση και στέγαση, σύμφωνα με τους ισχύοντες όρους που ορίζει το Γραφείο Φοιτητικής Μέριμνας του Πανεπιστημίου Κρήτης. Ειδικότερα, δικαίωμα αίτησης για δωρεάν σίτιση ή/και στέγαση έχουν οι ενεργοί μεταπτυχιακοί φοιτητές των οποίων η διάρκεια φοίτησης δεν έχει υπερβεί τη διάρκεια του ενδεικτικού προγράμματος σπουδών και δεν είναι κάτοχοι άλλου μεταπτυχιακού τίτλου. Η έκβαση της αίτησης είναι ευθύνη του Γραφείου Φοιτητικής Μέριμνας του Πανεπιστημίου Κρήτης με βάση την ισχύουσα νομοθεσία, τα οικονομικά διαθέσιμα του Πανεπιστημίου Κρήτης και τη σειρά κατάταξης των φοιτητών.
• Υγειονομική Περίθαλψη Ανασφάλιστων Φοιτητών/τριών: Οι μεταπτυχιακοί φοιτητές, που δεν έχουν άλλη ιατροφαρμακευτική́ και νοσοκομειακή περίθαλψη, δικαιούνται πλήρη ιατροφαρμακευτική και νοσοκομειακή περίθαλψη στο Εθνικό́ Σύστημα Υγειάς (Ε.Σ.Υ.) με κάλυψη των σχετικών δαπανών από́ τον Εθνικό́ Οργανισμό́ Παροχής Υπηρεσιών Υγείας (Ε.Ο.Π.Υ.Υ.). Επιπλέον, μπορούν να αιτηθούν για έκδοση Ευρωπαϊκής Κάρτας Ασφάλισης Ασθένειας (Ε.Κ.Α.Α.).